Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Smg8Q8VE18 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Smg8Q8VE18 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Smg8Q8VE18 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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