Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Ubxn4Q8VCH8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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