Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nup35Q8R4R6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms