Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms