Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28aQ8K3Y3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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