Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trim68Q8K243 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trim68Q8K243 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trim68Q8K243 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim68Q8K243 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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