Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

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Length 1,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rp1l1Q8CGM2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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