Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx8Q8CFD4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms