Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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