Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg4aQ8C9S8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms