Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms