Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms