Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrd1Q8C0R9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms