Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Nek11Q8C0Q4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Nek11Q8C0Q4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Nek11Q8C0Q4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Nek11Q8C0Q4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Nek11Q8C0Q4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Nek11Q8C0Q4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Nek11Q8C0Q4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Nek11Q8C0Q4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Nek11Q8C0Q4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek11Q8C0Q4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms