Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms