Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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