Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Snx17Q8BVL3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Snx17Q8BVL3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Snx17Q8BVL3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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