Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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