Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TicrrQ8BQ33 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TicrrQ8BQ33 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms