Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gtf3c4Q8BMQ2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gtf3c4Q8BMQ2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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