Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms