Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms