Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms