Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms