Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim65Q8BFW4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms