Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms