Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms