Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Alkbh8Q80Y20 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkbh8Q80Y20 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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