Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms