Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ClmQ7TSN2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms