Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms