Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox11Q7M6Y2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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