Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ScocQ78YZ6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ScocQ78YZ6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ScocQ78YZ6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ScocQ78YZ6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ScocQ78YZ6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ScocQ78YZ6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ScocQ78YZ6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ScocQ78YZ6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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