Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms