Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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