Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms