Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ccdc88cQ6VGS5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.2 ms