Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms