Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms