Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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