Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sarm1Q6PDS3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms