Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms