Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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