Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms