Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt87Q6IMF0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms