Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt42Q6IFX2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Krt42Q6IFX2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt42Q6IFX2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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