Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpd52Q62393 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpd52Q62393 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpd52Q62393 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpd52Q62393 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpd52Q62393 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpd52Q62393 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpd52Q62393 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpd52Q62393 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpd52Q62393 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpd52Q62393 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms