Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Aldh1a2Q62148 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms