Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms