Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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